Конохамару Сарутоби просит Наруто помочь в поисках легендарного тёмно-красного четырёхлистного клевера, который, по слухам, может исполнить любое желание. А желание у Конохамару одно — остановить отъезд своей возлюбленной Каэдэ Ёсино. Ситуация осложняется и тем, что уникальный клевер растёт лишь в запретной зоне. Но двое друзей всё же отправляются в полное опасностей путешествие.
На родную деревню Наруто нападают ниндзя-изгои и захватывают в заложники местных жителей. Цель нападавших — эликсир Вода героя, который на короткое время увеличивает чакру в 10 раз. Поскольку Какаси Хатакэ находится в отъезде, Наруто и его друзьям придётся самим разобраться с врагами.
Трое бездомных — алкоголик-бродяга Джин, трансвестит Хана и беглая беспризорница Миюки — живут на улицах Токио. Они уже давно позабыли, что значит иметь крышу над головой и есть три раза в день. Однажды в Сочельник троица находит на улице новорожденную девочку и решает во что бы то ни стало разыскать родителей малютки.
Наруто принимает участие в спортивных соревнованиях, но внезапно у него возникают проблемы с пищеварением.
Когда в семейный ресторанчик подруги молодого мангаки Ниси вошла парочка безбашенных якудза потребовать старые долги, парень погибает жалкой унизительной смертью. Но вознёсшейся на небеса душе Ниси удалось убедить Господа позволить ему заново пережить свои последние минуты. Вернувшись назад новым человеком и поклявшись в корне изменить свою жизнь, Ниси отбил подружку у бандитов, и вместе с ней и её сестрой они отправляются в полное неожиданностей сюрреалистическое путешествие навстречу большим
Шизоиды Панди и Ретро с отшибленной памятью очухиваются в центре Токио и устраивают беспредел - им нужна еда, шмотки и средство передвижения, и они не остановятся ни перед чем. Отмороженную парочку все-таки ловят и отправляют отбывать срок в знаменитую лунную тюрьму строгого режима, которую, по слухам, покинуть можно только в виде трупа.
Команда №7 вместе с Какаси должны сопровождать актрису Фудзикадзэ Юкиэ в Страну Снега. Прибыв на место, они сталкиваются с сильнейшими синоби, которые пытаются любыми способами завладеть предметом, принадлежащим актрисе.
Наруто решает принять участие в состязаниях ниндзя, в которых новички получают шанс схлестнуться со своими наставниками. Пытаясь сосредоточиться, Наруто становится одержим противостоянием с Какаси Хатакэ.
Во время миссии по поимке хорька на Сакуру, Сикамару и Наруто нападают неизвестные ниндзя. Наруто, разлучённый со своей группой, узнает о силе, которая не имеет ничего общего с Чакрой, и о древней исчезнувшей цивилизации. После воссоединения со своими товарищами, Наруто вынужден начать борьбу за спасение всего мира.
Школьник Ватануки Кимихиро обладает необычной способностью – он может видеть духов и других сверхъестественных существ, и эта способность его, откровенно говоря, раздражает. Однажды по дороге домой на Ватануки внезапно нападают духи, и уже через пару минут он, сам того не заметив, оказывается в чужом доме. Там он встречает Итихару Юко — таинственную женщину, которая утверждает, что может избавить последнего от способности видеть и притягивать к себе потусторонних существ. Взамен она предлагает